Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 515.57■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 39.76□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 46.39□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-20■■■■■ 44
FMR1Q06787 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-20■■■■■ 44
FMR1Q06787 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-20■■■■■ 44
FMR1Q06787 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-20■■■■■ 44
FMR1Q06787 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.832e-20■■■■■ 44
FMR1Q06787 SPTBN2-205ENST00000530665 462 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 44
FMR1Q06787 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.655e-9■■■■■ 43.6
FMR1Q06787 USP19-204ENST00000398896 3907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 43.6
FMR1Q06787 POLR2A-202ENST00000573603 648 ntTSL 216.12■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 43.6
FMR1Q06787 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 43.5
FMR1Q06787 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 43.5
FMR1Q06787 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 43.5
FMR1Q06787 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 327.08■■□□□ 1.933e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.823e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.663e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.463e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.343e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.293e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.183e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.123e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 221.78■■□□□ 1.083e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 USP11-202ENST00000377078 1077 ntTSL 521.61■■□□□ 1.053e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SPNS1-211ENST00000568829 780 ntTSL 521.07■□□□□ 0.963e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.923e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.813e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 USP11-207ENST00000478596 970 ntTSL 319.55■□□□□ 0.723e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-215ENST00000479019 1026 ntTSL 518.98■□□□□ 0.633e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.453e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.423e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-208ENST00000409927 583 ntTSL 317.63■□□□□ 0.413e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 LIMK2-208ENST00000467301 607 ntTSL 317.42■□□□□ 0.383e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.373e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 516.62■□□□□ 0.253e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 USP11-206ENST00000469080 3467 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-205ENST00000409805 983 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.533e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 USP11-203ENST00000377080 804 ntTSL 211.41□□□□□ -0.583e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.63e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 RABGAP1L-219ENST00000526253 439 ntTSL 511.07□□□□□ -0.643e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.763e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.923e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.093e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 57.21□□□□□ -1.263e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-23■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 RABGGTB-203ENST00000459697 1177 ntTSL 27.14□□□□□ -1.272e-23■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.573e-12■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.19□□□□□ -1.582e-23■■■■■ 43.2
FMR1Q06787 SF3A3-203ENST00000461869 776 ntTSL 320.1■□□□□ 0.813e-11■■■■■ 43.1
FMR1Q06787 SF3A3-204ENST00000462258 527 ntTSL 212.84□□□□□ -0.353e-11■■■■■ 43.1
FMR1Q06787 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.683e-11■■■■■ 43.1
FMR1Q06787 SF3A3-205ENST00000470585 704 ntTSL 39.02□□□□□ -0.973e-11■■■■■ 43.1
FMR1Q06787 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.928e-16■■■■■ 43
FMR1Q06787 BCOR-208ENST00000413905 1945 ntTSL 514.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 43
FMR1Q06787 BCOR-204ENST00000378463 2230 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 43
FMR1Q06787 ATF1-202ENST00000549612 568 ntTSL 524.86■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 42.9
FMR1Q06787 ATF1-204ENST00000552487 745 ntTSL 514.02□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 42.9
FMR1Q06787 ATF1-203ENST00000551831 970 ntTSL 27.31□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 42.9
FMR1Q06787 ATF1-205ENST00000552510 549 ntTSL 57.06□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 42.9
FMR1Q06787 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.841e-6■■■■■ 42.9
FMR1Q06787 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 212.34□□□□□ -0.434e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.764e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-215ENST00000464410 593 ntTSL 48.81□□□□□ -14e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.094e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 28.21□□□□□ -1.14e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.134e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 27.29□□□□□ -1.244e-23■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.731e-9■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 314.96□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 42.7
FMR1Q06787 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 42.6
FMR1Q06787 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 42.6
FMR1Q06787 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 42.6
FMR1Q06787 USP34-207ENST00000463046 6307 ntTSL 26.35□□□□□ -1.393e-9■■■■■ 42.6
FMR1Q06787 USP34-202ENST00000411912 4309 ntTSL 54.48□□□□□ -1.693e-9■■■■■ 42.6
FMR1Q06787 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.511e-8■■■■■ 42.6
FMR1Q06787 C7orf73-203ENST00000509448 581 ntTSL 422.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 42.3
FMR1Q06787 C7orf73-201ENST00000422968 2004 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 42.3
FMR1Q06787 C7orf73-204ENST00000515197 617 ntTSL 210.15□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 42.3
FMR1Q06787 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 42.3
FMR1Q06787 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.76e-12■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 42.2
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 83 ms