RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.15■■■■■ 4.34
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USP11-202ENST00000377078 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.7■■■■□ 3.31
USP11-202ENST00000377078 NACADO15069 1562 aa35.55■■■■□ 3.28
USP11-202ENST00000377078 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.47■■■■□ 3.27
USP11-202ENST00000377078 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.19■■■■□ 3.22
USP11-202ENST00000377078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
USP11-202ENST00000377078 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.88■■■■□ 3.17
USP11-202ENST00000377078 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.75■■■■□ 3.15
USP11-202ENST00000377078 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.74■■■■□ 3.15
USP11-202ENST00000377078 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.52■■■■□ 3.12
USP11-202ENST00000377078 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.48■■■■□ 3.11
USP11-202ENST00000377078 SCRIBQ14160 1630 aa34.33■■■■□ 3.09
USP11-202ENST00000377078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.26■■■■□ 3.07
USP11-202ENST00000377078 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
USP11-202ENST00000377078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.66■■■□□ 2.98
USP11-202ENST00000377078 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.55■■■□□ 2.96
USP11-202ENST00000377078 SMARCA4P51532 1647 aa32.8■■■□□ 2.84
USP11-202ENST00000377078 NCAPD3P42695 1498 aa32.79■■■□□ 2.84
USP11-202ENST00000377078 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
USP11-202ENST00000377078 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.73■■■□□ 2.83
USP11-202ENST00000377078 SMARCA2P51531 1590 aa32.72■■■□□ 2.83
USP11-202ENST00000377078 HMGXB3Q12766 1538 aa32.6■■■□□ 2.81
USP11-202ENST00000377078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
USP11-202ENST00000377078 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.48■■■□□ 2.79
USP11-202ENST00000377078 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.44■■■□□ 2.78
USP11-202ENST00000377078 ERCC6Q03468 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
USP11-202ENST00000377078 NESP48681 1621 aa32.08■■■□□ 2.73
USP11-202ENST00000377078 WIZO95785 1651 aa32.07■■■□□ 2.72
USP11-202ENST00000377078 CUX2O14529 1486 aa32.01■■■□□ 2.71
USP11-202ENST00000377078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.01■■■□□ 2.71
USP11-202ENST00000377078 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
USP11-202ENST00000377078 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.85■■■□□ 2.69
USP11-202ENST00000377078 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.82■■■□□ 2.69
USP11-202ENST00000377078 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
USP11-202ENST00000377078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.69■■■□□ 2.66
USP11-202ENST00000377078 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
USP11-202ENST00000377078 CFTRP13569 1480 aa31.53■■■□□ 2.64
USP11-202ENST00000377078 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.51■■■□□ 2.63
USP11-202ENST00000377078 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.48■■■□□ 2.63
USP11-202ENST00000377078 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.48■■■□□ 2.63
USP11-202ENST00000377078 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.46■■■□□ 2.63
USP11-202ENST00000377078 WDR62O43379 1518 aa31.39■■■□□ 2.62
USP11-202ENST00000377078 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.36■■■□□ 2.61
USP11-202ENST00000377078 PRDM2Q13029 1718 aa31.24■■■□□ 2.59
USP11-202ENST00000377078 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
USP11-202ENST00000377078 ABCC8Q09428 1581 aa30.94■■■□□ 2.54
USP11-202ENST00000377078 TOPBP1Q92547 1522 aa30.89■■■□□ 2.54
USP11-202ENST00000377078 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
USP11-202ENST00000377078 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.83■■■□□ 2.53
USP11-202ENST00000377078 IFT140Q96RY7 1462 aa30.83■■■□□ 2.53
USP11-202ENST00000377078 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
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USP11-202ENST00000377078 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
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USP11-202ENST00000377078 SOGA1O94964 1423 aa30.5■■■□□ 2.47
USP11-202ENST00000377078 CUX1P39880 1505 aa30.47■■■□□ 2.47
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USP11-202ENST00000377078 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
USP11-202ENST00000377078 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.44■■■□□ 2.46
USP11-202ENST00000377078 WDR97A6NE52 1622 aa30.37■■■□□ 2.45
USP11-202ENST00000377078 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
USP11-202ENST00000377078 TRIM41Q8WV44 630 aa30.31■■■□□ 2.44
USP11-202ENST00000377078 FBLN2P98095 1184 aa30.26■■■□□ 2.43
USP11-202ENST00000377078 CHD1O14646 1710 aa30.22■■■□□ 2.43
USP11-202ENST00000377078 GRIN2BQ13224 1484 aa30.2■■■□□ 2.43
USP11-202ENST00000377078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
USP11-202ENST00000377078 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.19■■■□□ 2.42
USP11-202ENST00000377078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
USP11-202ENST00000377078 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.16■■■□□ 2.42
USP11-202ENST00000377078 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.14■■■□□ 2.42
USP11-202ENST00000377078 TOP2BQ02880 1626 aa30.13■■■□□ 2.41
USP11-202ENST00000377078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
USP11-202ENST00000377078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.11■■■□□ 2.41
USP11-202ENST00000377078 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
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USP11-202ENST00000377078 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.09■■■□□ 2.41
USP11-202ENST00000377078 ARHGEF11O15085 1522 aa30.07■■■□□ 2.4
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USP11-202ENST00000377078 SYNJ2O15056 1496 aa30.06■■■□□ 2.4
USP11-202ENST00000377078 PBRM1Q86U86 1689 aa30.05■■■□□ 2.4
USP11-202ENST00000377078 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.04■■■□□ 2.4
USP11-202ENST00000377078 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.9■■■□□ 2.38
USP11-202ENST00000377078 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.85■■■□□ 2.37
USP11-202ENST00000377078 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
USP11-202ENST00000377078 ADAMTS12P58397 1594 aa29.81■■■□□ 2.36
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USP11-202ENST00000377078 NUP160Q12769 1436 aa29.66■■■□□ 2.34
USP11-202ENST00000377078 KIF27Q86VH2 1401 aa29.62■■■□□ 2.33
USP11-202ENST00000377078 CEP170Q5SW79 1584 aa29.62■■■□□ 2.33
USP11-202ENST00000377078 IGF1RP08069 1367 aa29.49■■■□□ 2.31
USP11-202ENST00000377078 CUL7Q14999 1698 aa29.47■■■□□ 2.31
USP11-202ENST00000377078 SHROOM2Q13796 1616 aa29.45■■■□□ 2.31
USP11-202ENST00000377078 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
USP11-202ENST00000377078 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.4■■■□□ 2.3
USP11-202ENST00000377078 JPH4Q96JJ6 628 aa29.39■■■□□ 2.3
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