Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NAP1L1P55209 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L1P55209 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NAP1L1P55209 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAP1L1P55209 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L1P55209 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms