Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTTPP55157 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTTPP55157 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTTPP55157 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTTPP55157 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTTPP55157 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTTPP55157 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTTPP55157 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTTPP55157 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTTPP55157 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTTPP55157 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTTPP55157 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTTPP55157 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTTPP55157 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTTPP55157 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTTPP55157 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTTPP55157 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTTPP55157 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTTPP55157 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTTPP55157 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTTPP55157 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTTPP55157 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTTPP55157 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTTPP55157 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTTPP55157 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTTPP55157 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTTPP55157 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTTPP55157 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTTPP55157 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTTPP55157 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTTPP55157 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTTPP55157 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTTPP55157 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTTPP55157 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTTPP55157 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTTPP55157 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTTPP55157 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTTPP55157 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTTPP55157 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTTPP55157 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTTPP55157 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTTPP55157 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTTPP55157 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTTPP55157 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTTPP55157 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTTPP55157 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTTPP55157 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTTPP55157 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTTPP55157 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTTPP55157 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTTPP55157 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTTPP55157 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTTPP55157 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTTPP55157 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTTPP55157 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTTPP55157 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTTPP55157 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTTPP55157 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTTPP55157 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTTPP55157 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTTPP55157 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTTPP55157 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTTPP55157 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTTPP55157 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTTPP55157 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTTPP55157 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTTPP55157 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTTPP55157 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTTPP55157 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTTPP55157 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTTPP55157 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTTPP55157 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms