Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC2O95347 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC2O95347 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC2O95347 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC2O95347 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC2O95347 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC2O95347 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC2O95347 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC2O95347 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC2O95347 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC2O95347 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC2O95347 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC2O95347 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC2O95347 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC2O95347 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC2O95347 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC2O95347 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC2O95347 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC2O95347 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC2O95347 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC2O95347 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC2O95347 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC2O95347 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC2O95347 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC2O95347 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC2O95347 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC2O95347 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC2O95347 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC2O95347 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC2O95347 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC2O95347 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC2O95347 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC2O95347 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC2O95347 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC2O95347 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMC2O95347 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC2O95347 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC2O95347 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC2O95347 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC2O95347 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC2O95347 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC2O95347 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC2O95347 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC2O95347 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC2O95347 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC2O95347 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC2O95347 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC2O95347 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC2O95347 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC2O95347 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC2O95347 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMC2O95347 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMC2O95347 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMC2O95347 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMC2O95347 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC2O95347 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC2O95347 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC2O95347 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC2O95347 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC2O95347 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC2O95347 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC2O95347 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC2O95347 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC2O95347 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC2O95347 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC2O95347 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC2O95347 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC2O95347 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC2O95347 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC2O95347 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC2O95347 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC2O95347 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC2O95347 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMC2O95347 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC2O95347 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC2O95347 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC2O95347 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC2O95347 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMC2O95347 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC2O95347 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC2O95347 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC2O95347 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMC2O95347 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC2O95347 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC2O95347 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMC2O95347 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC2O95347 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMC2O95347 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC2O95347 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC2O95347 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC2O95347 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC2O95347 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC2O95347 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMC2O95347 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms