Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRCPO75575 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRCPO75575 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRCPO75575 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRCPO75575 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRCPO75575 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRCPO75575 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRCPO75575 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRCPO75575 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRCPO75575 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRCPO75575 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRCPO75575 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRCPO75575 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRCPO75575 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRCPO75575 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRCPO75575 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRCPO75575 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRCPO75575 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRCPO75575 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRCPO75575 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRCPO75575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRCPO75575 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRCPO75575 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRCPO75575 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRCPO75575 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRCPO75575 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRCPO75575 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRCPO75575 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRCPO75575 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRCPO75575 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRCPO75575 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRCPO75575 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRCPO75575 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRCPO75575 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRCPO75575 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRCPO75575 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRCPO75575 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRCPO75575 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRCPO75575 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRCPO75575 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRCPO75575 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRCPO75575 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRCPO75575 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRCPO75575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRCPO75575 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRCPO75575 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRCPO75575 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRCPO75575 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRCPO75575 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRCPO75575 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRCPO75575 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRCPO75575 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRCPO75575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRCPO75575 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRCPO75575 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRCPO75575 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRCPO75575 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRCPO75575 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRCPO75575 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRCPO75575 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRCPO75575 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRCPO75575 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRCPO75575 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRCPO75575 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRCPO75575 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRCPO75575 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRCPO75575 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRCPO75575 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRCPO75575 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRCPO75575 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRCPO75575 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRCPO75575 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRCPO75575 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRCPO75575 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRCPO75575 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRCPO75575 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRCPO75575 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRCPO75575 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRCPO75575 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRCPO75575 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRCPO75575 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRCPO75575 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRCPO75575 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRCPO75575 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRCPO75575 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRCPO75575 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRCPO75575 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRCPO75575 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRCPO75575 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRCPO75575 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRCPO75575 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRCPO75575 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRCPO75575 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRCPO75575 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms