Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF13O43567 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF13O43567 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF13O43567 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF13O43567 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF13O43567 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF13O43567 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF13O43567 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF13O43567 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF13O43567 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF13O43567 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF13O43567 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF13O43567 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF13O43567 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF13O43567 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF13O43567 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF13O43567 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF13O43567 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF13O43567 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF13O43567 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF13O43567 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF13O43567 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF13O43567 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF13O43567 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF13O43567 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF13O43567 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF13O43567 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF13O43567 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF13O43567 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF13O43567 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF13O43567 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF13O43567 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF13O43567 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF13O43567 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF13O43567 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF13O43567 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF13O43567 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF13O43567 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF13O43567 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF13O43567 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF13O43567 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF13O43567 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF13O43567 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF13O43567 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF13O43567 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF13O43567 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF13O43567 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF13O43567 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF13O43567 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF13O43567 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF13O43567 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF13O43567 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF13O43567 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF13O43567 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF13O43567 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF13O43567 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF13O43567 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF13O43567 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF13O43567 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF13O43567 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF13O43567 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF13O43567 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF13O43567 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF13O43567 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF13O43567 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF13O43567 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF13O43567 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF13O43567 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF13O43567 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF13O43567 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF13O43567 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF13O43567 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF13O43567 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms