Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO5BA8MYB1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO5BA8MYB1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO5BA8MYB1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO5BA8MYB1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms