Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms