RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612323.4

TMEM230-210, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM230, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-210ENST00000612323 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.77■■■■■ 6.04
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TMEM230-210ENST00000612323 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.77■■■■■ 4.76
TMEM230-210ENST00000612323 NACADO15069 1562 aa44.55■■■■■ 4.72
TMEM230-210ENST00000612323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.36■■■■■ 4.69
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TMEM230-210ENST00000612323 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.02■■■■■ 4.64
TMEM230-210ENST00000612323 MYO15BQ96JP2 1530 aa44■■■■■ 4.63
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TMEM230-210ENST00000612323 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.55■■■■■ 4.56
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TMEM230-210ENST00000612323 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.51■■■■■ 4.4
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TMEM230-210ENST00000612323 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.29■■■■■ 4.36
TMEM230-210ENST00000612323 NCAPD3P42695 1498 aa41.16■■■■■ 4.18
TMEM230-210ENST00000612323 SMARCA4P51532 1647 aa41.12■■■■■ 4.17
TMEM230-210ENST00000612323 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.09■■■■■ 4.17
TMEM230-210ENST00000612323 SMARCA2P51531 1590 aa40.9■■■■■ 4.14
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TMEM230-210ENST00000612323 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.74■■■■■ 4.11
TMEM230-210ENST00000612323 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.71■■■■■ 4.11
TMEM230-210ENST00000612323 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
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TMEM230-210ENST00000612323 CUX2O14529 1486 aa40.32■■■■■ 4.05
TMEM230-210ENST00000612323 WIZO95785 1651 aa40.27■■■■■ 4.04
TMEM230-210ENST00000612323 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.15■■■■■ 4.02
TMEM230-210ENST00000612323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.12■■■■■ 4.01
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TMEM230-210ENST00000612323 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.56■■■■□ 3.92
TMEM230-210ENST00000612323 CFTRP13569 1480 aa39.52■■■■□ 3.92
TMEM230-210ENST00000612323 WDR62O43379 1518 aa39.49■■■■□ 3.91
TMEM230-210ENST00000612323 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.45■■■■□ 3.91
TMEM230-210ENST00000612323 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.43■■■■□ 3.9
TMEM230-210ENST00000612323 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.29■■■■□ 3.88
TMEM230-210ENST00000612323 PRDM2Q13029 1718 aa39.2■■■■□ 3.87
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TMEM230-210ENST00000612323 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
TMEM230-210ENST00000612323 IFT140Q96RY7 1462 aa38.62■■■■□ 3.77
TMEM230-210ENST00000612323 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.61■■■■□ 3.77
TMEM230-210ENST00000612323 ABCC8Q09428 1581 aa38.57■■■■□ 3.76
TMEM230-210ENST00000612323 OSCARQ8IYS5 282 aa38.53■■■■□ 3.76
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TMEM230-210ENST00000612323 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.17■■■■□ 3.7
TMEM230-210ENST00000612323 CHD1O14646 1710 aa38.15■■■■□ 3.7
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TMEM230-210ENST00000612323 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.12■■■■□ 3.69
TMEM230-210ENST00000612323 ARHGEF11O15085 1522 aa37.98■■■■□ 3.67
TMEM230-210ENST00000612323 WDR97A6NE52 1622 aa37.97■■■■□ 3.67
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TMEM230-210ENST00000612323 GRIN2BQ13224 1484 aa37.78■■■■□ 3.64
TMEM230-210ENST00000612323 PBRM1Q86U86 1689 aa37.76■■■■□ 3.63
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TMEM230-210ENST00000612323 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.68■■■■□ 3.62
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TMEM230-210ENST00000612323 ARAP1Q96P48 1450 aa37.66■■■■□ 3.62
TMEM230-210ENST00000612323 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.66■■■■□ 3.62
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TMEM230-210ENST00000612323 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
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TMEM230-210ENST00000612323 CEP170Q5SW79 1584 aa37.27■■■■□ 3.56
TMEM230-210ENST00000612323 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.24■■■■□ 3.55
TMEM230-210ENST00000612323 NUP160Q12769 1436 aa37.23■■■■□ 3.55
TMEM230-210ENST00000612323 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.21■■■■□ 3.55
TMEM230-210ENST00000612323 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.21■■■■□ 3.55
TMEM230-210ENST00000612323 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
TMEM230-210ENST00000612323 SHROOM2Q13796 1616 aa37.07■■■■□ 3.53
TMEM230-210ENST00000612323 IGF1RP08069 1367 aa36.9■■■■□ 3.5
TMEM230-210ENST00000612323 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.84■■■■□ 3.49
TMEM230-210ENST00000612323 JPH4Q96JJ6 628 aa36.82■■■■□ 3.48
TMEM230-210ENST00000612323 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
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