RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378675.7

MMP23B-202, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP23B, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-202ENST00000378675 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.3■■■■■ 5.64
MMP23B-202ENST00000378675 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.78■■■■■ 4.76
MMP23B-202ENST00000378675 ABCC9O60706 1549 aa44.16■■■■■ 4.66
MMP23B-202ENST00000378675 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.32■■■■■ 4.37
MMP23B-202ENST00000378675 NACADO15069 1562 aa42.21■■■■■ 4.35
MMP23B-202ENST00000378675 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.2■■■■■ 4.35
MMP23B-202ENST00000378675 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.88■■■■■ 4.29
MMP23B-202ENST00000378675 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
MMP23B-202ENST00000378675 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.59■■■■■ 4.25
MMP23B-202ENST00000378675 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.38■■■■■ 4.21
MMP23B-202ENST00000378675 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
MMP23B-202ENST00000378675 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.1■■■■■ 4.17
MMP23B-202ENST00000378675 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.93■■■■■ 4.14
MMP23B-202ENST00000378675 SCRIBQ14160 1630 aa40.85■■■■■ 4.13
MMP23B-202ENST00000378675 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.57■■■■■ 4.08
MMP23B-202ENST00000378675 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
MMP23B-202ENST00000378675 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.92■■■■□ 3.98
MMP23B-202ENST00000378675 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.71■■■■□ 3.95
MMP23B-202ENST00000378675 SMARCA4P51532 1647 aa39.06■■■■□ 3.84
MMP23B-202ENST00000378675 NCAPD3P42695 1498 aa39■■■■□ 3.83
MMP23B-202ENST00000378675 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
MMP23B-202ENST00000378675 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.97■■■■□ 3.83
MMP23B-202ENST00000378675 SMARCA2P51531 1590 aa38.86■■■■□ 3.81
MMP23B-202ENST00000378675 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.77■■■■□ 3.8
MMP23B-202ENST00000378675 HMGXB3Q12766 1538 aa38.71■■■■□ 3.79
MMP23B-202ENST00000378675 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.69■■■■□ 3.78
MMP23B-202ENST00000378675 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
MMP23B-202ENST00000378675 WIZO95785 1651 aa38.32■■■■□ 3.73
MMP23B-202ENST00000378675 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
MMP23B-202ENST00000378675 NESP48681 1621 aa38.15■■■■□ 3.7
MMP23B-202ENST00000378675 ERCC6Q03468 1493 aa38.04■■■■□ 3.68
MMP23B-202ENST00000378675 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.97■■■■□ 3.67
MMP23B-202ENST00000378675 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
MMP23B-202ENST00000378675 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.85■■■■□ 3.65
MMP23B-202ENST00000378675 CUX2O14529 1486 aa37.77■■■■□ 3.64
MMP23B-202ENST00000378675 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.75■■■■□ 3.63
MMP23B-202ENST00000378675 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.64■■■■□ 3.62
MMP23B-202ENST00000378675 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
MMP23B-202ENST00000378675 CFTRP13569 1480 aa37.55■■■■□ 3.6
MMP23B-202ENST00000378675 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.49■■■■□ 3.59
MMP23B-202ENST00000378675 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.38■■■■□ 3.57
MMP23B-202ENST00000378675 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.35■■■■□ 3.57
MMP23B-202ENST00000378675 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.33■■■■□ 3.57
MMP23B-202ENST00000378675 WDR62O43379 1518 aa37.23■■■■□ 3.55
MMP23B-202ENST00000378675 PRDM2Q13029 1718 aa37.16■■■■□ 3.54
MMP23B-202ENST00000378675 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.07■■■■□ 3.52
MMP23B-202ENST00000378675 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
MMP23B-202ENST00000378675 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
MMP23B-202ENST00000378675 TOPBP1Q92547 1522 aa36.75■■■■□ 3.47
MMP23B-202ENST00000378675 ABCC8Q09428 1581 aa36.74■■■■□ 3.47
MMP23B-202ENST00000378675 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.66■■■■□ 3.46
MMP23B-202ENST00000378675 IFT140Q96RY7 1462 aa36.59■■■■□ 3.45
MMP23B-202ENST00000378675 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
MMP23B-202ENST00000378675 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
MMP23B-202ENST00000378675 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
MMP23B-202ENST00000378675 CUX1P39880 1505 aa36.37■■■■□ 3.41
MMP23B-202ENST00000378675 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.3■■■■□ 3.4
MMP23B-202ENST00000378675 SOGA1O94964 1423 aa36.3■■■■□ 3.4
MMP23B-202ENST00000378675 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.28■■■■□ 3.4
MMP23B-202ENST00000378675 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.39
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MMP23B-202ENST00000378675 OSCARQ8IYS5 282 aa36.24■■■■□ 3.39
MMP23B-202ENST00000378675 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
MMP23B-202ENST00000378675 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
MMP23B-202ENST00000378675 WDR97A6NE52 1622 aa36.02■■■■□ 3.36
MMP23B-202ENST00000378675 TOP2BQ02880 1626 aa35.96■■■■□ 3.35
MMP23B-202ENST00000378675 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.95■■■■□ 3.35
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MMP23B-202ENST00000378675 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.93■■■■□ 3.34
MMP23B-202ENST00000378675 GRIN2BQ13224 1484 aa35.88■■■■□ 3.33
MMP23B-202ENST00000378675 FBLN2P98095 1184 aa35.87■■■■□ 3.33
MMP23B-202ENST00000378675 CHD1O14646 1710 aa35.87■■■■□ 3.33
MMP23B-202ENST00000378675 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.85■■■■□ 3.33
MMP23B-202ENST00000378675 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.85■■■■□ 3.33
MMP23B-202ENST00000378675 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
MMP23B-202ENST00000378675 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.78■■■■□ 3.32
MMP23B-202ENST00000378675 PBRM1Q86U86 1689 aa35.74■■■■□ 3.31
MMP23B-202ENST00000378675 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
MMP23B-202ENST00000378675 TRIM41Q8WV44 630 aa35.67■■■■□ 3.3
MMP23B-202ENST00000378675 SYNJ2O15056 1496 aa35.67■■■■□ 3.3
MMP23B-202ENST00000378675 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.62■■■■□ 3.29
MMP23B-202ENST00000378675 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.62■■■■□ 3.29
MMP23B-202ENST00000378675 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.62■■■■□ 3.29
MMP23B-202ENST00000378675 ARHGEF11O15085 1522 aa35.58■■■■□ 3.29
MMP23B-202ENST00000378675 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.5■■■■□ 3.27
MMP23B-202ENST00000378675 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.47■■■■□ 3.27
MMP23B-202ENST00000378675 ADAMTS12P58397 1594 aa35.44■■■■□ 3.26
MMP23B-202ENST00000378675 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.43■■■■□ 3.26
MMP23B-202ENST00000378675 GRIN2AQ12879 1464 aa35.41■■■■□ 3.26
MMP23B-202ENST00000378675 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.33■■■■□ 3.25
MMP23B-202ENST00000378675 KIF27Q86VH2 1401 aa35.29■■■■□ 3.24
MMP23B-202ENST00000378675 ARAP1Q96P48 1450 aa35.28■■■■□ 3.24
MMP23B-202ENST00000378675 NUP160Q12769 1436 aa35.27■■■■□ 3.24
MMP23B-202ENST00000378675 IGF1RP08069 1367 aa35.26■■■■□ 3.24
MMP23B-202ENST00000378675 CEP170Q5SW79 1584 aa35.24■■■■□ 3.23
MMP23B-202ENST00000378675 CUL7Q14999 1698 aa35.06■■■■□ 3.2
MMP23B-202ENST00000378675 SHROOM2Q13796 1616 aa35.03■■■■□ 3.2
MMP23B-202ENST00000378675 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.02■■■■□ 3.2
MMP23B-202ENST00000378675 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.01■■■■□ 3.2
MMP23B-202ENST00000378675 JPH4Q96JJ6 628 aa34.99■■■■□ 3.19
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