Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 TARDBP-205ENST00000473118 701 ntTSL 312.03□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.035e-8■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.255e-8■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-8■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 224.79■■□□□ 1.564e-7■■■□□ 15.4
DROSHAQ9NRR4 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 217.53■□□□□ 0.41e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.31e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 310.03□□□□□ -0.81e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.063e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 324.95■■□□□ 1.593e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 COMT-210ENST00000467943 546 ntTSL 236.8■■■■□ 3.483e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.752e-13■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 225.95■■□□□ 1.752e-13■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.542e-13■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-204ENST00000418304 1759 ntTSL 526.5■■□□□ 1.835e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-208ENST00000466653 2315 ntTSL 225.4■■□□□ 1.665e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-207ENST00000462969 273 ntTSL 223.11■■□□□ 1.295e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.325e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.15e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.055e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 528.44■■■□□ 2.147e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.964e-9■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.542e-6■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.922e-6■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 242.29■■■■■ 4.366e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.654e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)26.33■■□□□ 1.84e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.59e-7■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 538.91■■■■□ 3.827e-10■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.567e-10■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.17e-10■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.732e-9■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 MVD-204ENST00000562741 217 ntTSL 233.57■■■□□ 2.969e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 325.43■■□□□ 1.669e-8■■■□□ 15.3
DROSHAQ9NRR4 NADK-203ENST00000342348 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.91■■□□□ 1.583e-9■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-204ENST00000525616 780 ntTSL 234.97■■■■□ 3.191e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 229.73■■■□□ 2.351e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 329.36■■■□□ 2.291e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 325.03■■□□□ 1.61e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 319.46■□□□□ 0.711e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 319.46■□□□□ 0.711e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 319.42■□□□□ 0.71e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 517.64■□□□□ 0.411e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PRMT1-205ENST00000525915 298 ntTSL 38.02□□□□□ -1.131e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 DNM2-207ENST00000586939 551 ntTSL 419.02■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.554e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-214ENST00000621487 473 ntTSL 225.17■■□□□ 1.628e-15■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRVP-203ENST00000638692 1189 ntTSL 1 (best)26.72■■□□□ 1.872e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 521.94■■□□□ 1.12e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 12e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.184e-8■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.454e-8■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.464e-8■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 224.12■■□□□ 1.454e-7■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 229.33■■■□□ 2.292e-11■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.392e-11■■■□□ 15.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-242ENST00000531377 816 ntTSL 527.49■■□□□ 1.996e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 327.97■■■□□ 2.072e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 518.43■□□□□ 0.542e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 518.3■□□□□ 0.523e-8■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.535e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.145e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MTHFR-216ENST00000641805 2945 nt19.47■□□□□ 0.715e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MTHFR-212ENST00000641446 2820 nt18.83■□□□□ 0.65e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MTHFR-215ENST00000641759 2454 nt17.86■□□□□ 0.455e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt16.36■□□□□ 0.215e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC17.91■□□□□ 0.461e-76■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt17.33■□□□□ 0.361e-76■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt16.81■□□□□ 0.281e-76■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 337.79■■■■□ 3.643e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.943e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.123e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.123e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.643e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 CYTH1-217ENST00000592497 454 ntTSL 312.9□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.24■□□□□ 0.997e-8■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.14■■■■■ 4.981e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.311e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 EGLN2-208ENST00000593972 935 ntTSL 237.61■■■■□ 3.611e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 EGLN2-215ENST00000598654 590 ntTSL 334.79■■■■□ 3.161e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.361e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 RAB4B-EGLN2-203ENST00000601949 482 ntTSL 428.46■■■□□ 2.151e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.041e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PPIF-204ENST00000492149 646 ntTSL 226.2■■□□□ 1.791e-15■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PPIF-203ENST00000472580 761 ntTSL 526.15■■□□□ 1.781e-15■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PPIF-205ENST00000498681 518 ntTSL 226.15■■□□□ 1.781e-15■■■□□ 15.1
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