RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTPRVP-205ENST00000641549 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRVP-205ENST00000641549 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTPRVP-205ENST00000641549 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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PTPRVP-205ENST00000641549 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
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PTPRVP-205ENST00000641549 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PTPRVP-205ENST00000641549 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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PTPRVP-205ENST00000641549 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
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PTPRVP-205ENST00000641549 ITGAEP38570 1179 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRVP-205ENST00000641549 HRCP23327 699 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRVP-205ENST00000641549 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.61■□□□□ 0.73
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PTPRVP-205ENST00000641549 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.46■□□□□ 0.71
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PTPRVP-205ENST00000641549 MYT1Q01538 1121 aa19.32■□□□□ 0.68
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PTPRVP-205ENST00000641549 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.04■□□□□ 0.64
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PTPRVP-205ENST00000641549 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRVP-205ENST00000641549 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
PTPRVP-205ENST00000641549 P3H3Q8IVL6 736 aa18.94■□□□□ 0.62
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PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
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PTPRVP-205ENST00000641549 EEA1Q15075 1411 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRVP-205ENST00000641549 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.68■□□□□ 0.58
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PTPRVP-205ENST00000641549 TONSLQ96HA7 1378 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRVP-205ENST00000641549 CLIP1P30622 1438 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 NEFMP07197 916 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 27.9
PTPRVP-205ENST00000641549 BCANQ96GW7 911 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA3Q08378 1498 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-205ENST00000641549 TSPY4P0CV99 314 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-205ENST00000641549 TSPY10P0CW01 314 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-205ENST00000641549 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-205ENST00000641549 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-205ENST00000641549 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-205ENST00000641549 KIF27Q86VH2 1401 aa18.46■□□□□ 0.55
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PTPRVP-205ENST00000641549 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRVP-205ENST00000641549 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRVP-205ENST00000641549 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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PTPRVP-205ENST00000641549 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC24A1O60721 1099 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRVP-205ENST00000641549 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRVP-205ENST00000641549 ERCC6Q03468 1493 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 TMC1Q8TDI8 760 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 SMARCA2P51531 1590 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 25.7
PTPRVP-205ENST00000641549 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.14■□□□□ 0.49
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