Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RACGAP1-220ENST00000550651 551 ntTSL 416.75■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 216.62■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RACGAP1-207ENST00000546786 568 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-212ENST00000595118 2446 ntTSL 216.5■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 LTBP4-233ENST00000612121 755 ntTSL 316.25■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-214ENST00000595665 576 ntTSL 416.04■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 LTBP4-236ENST00000618486 567 ntTSL 416.04■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-207ENST00000593463 573 ntTSL 416.04■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 HIKESHI-202ENST00000528004 1409 ntTSL 215.17■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 TSC1-205ENST00000475903 820 ntTSL 414.47□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 JPT1-204ENST00000465454 509 ntTSL 412.98□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ZNF692-205ENST00000462037 827 ntTSL 212.86□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 HDGFL2-202ENST00000589486 805 ntTSL 512.65□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 212.64□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 412.44□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-215ENST00000596351 512 ntTSL 212.31□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 METTL15-212ENST00000634973 1353 ntTSL 512.24□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 20.8
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