Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.885e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 519.93■□□□□ 0.785e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 319.64■□□□□ 0.735e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.35e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 VIL1-203ENST00000419986 639 ntTSL 315.4■□□□□ 0.064e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.932e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.472e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 222.78■■□□□ 1.241e-6■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CORO1C-206ENST00000546705 577 ntTSL 316.6■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACTN1-206ENST00000544964 891 ntTSL 515.31■□□□□ 0.041e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-23■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 520.41■□□□□ 0.861e-23■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.581e-23■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 518.49■□□□□ 0.551e-23■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 521.81■■□□□ 1.082e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACLY-210ENST00000592970 540 ntTSL 412.59□□□□□ -0.392e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SORD-204ENST00000558789 1553 ntTSL 219.1■□□□□ 0.655e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SORD-205ENST00000559230 1502 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.065e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SORD-203ENST00000558580 1395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.475e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CTNNA1-212ENST00000518919 498 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.511e-15■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 GOT2-204ENST00000494627 889 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HERPUD1-210ENST00000565966 798 ntTSL 517.13■□□□□ 0.336e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HERPUD1-218ENST00000569569 1125 ntTSL 217.13■□□□□ 0.336e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HERPUD1-206ENST00000563343 567 ntTSL 49.38□□□□□ -0.916e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HERPUD1-217ENST00000569429 562 ntTSL 47.86□□□□□ -1.156e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HERPUD1-207ENST00000563781 774 ntTSL 36.4□□□□□ -1.386e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.466e-29■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 FABP1-204ENST00000495375 2084 ntTSL 317.44■□□□□ 0.386e-29■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.726e-29■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.56e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.076e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.86e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 226■■□□□ 1.756e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 324.85■■□□□ 1.576e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)24.27■■□□□ 1.486e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.396e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.376e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-205ENST00000421218 869 ntTSL 521.74■■□□□ 1.076e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-208ENST00000447223 915 ntTSL 319.76■□□□□ 0.756e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-216ENST00000480865 1540 ntTSL 518.85■□□□□ 0.616e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 ACAA1-214ENST00000469559 4720 ntTSL 214.75□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEC31A-224ENST00000507828 1329 ntTSL 56.08□□□□□ -1.444e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SEC31A-234ENST00000512664 710 ntTSL 35.2□□□□□ -1.584e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.962e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.226e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.936e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 223.56■■□□□ 1.366e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.886e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 25.43□□□□□ -1.546e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.566e-9■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.365e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 MYL12A-204ENST00000578038 463 ntTSL 35.75□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CALM3-207ENST00000595072 721 ntTSL 214.14□□□□□ -0.157e-8■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.887e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.487e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.247e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.57e-10■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 POLR2A-205ENST00000576114 245 ntTSL 28.69□□□□□ -1.027e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 331.87■■■□□ 2.699e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CHERP-202ENST00000544299 1755 ntTSL 222.32■■□□□ 1.169e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-206ENST00000598807 970 ntTSL 221.19■□□□□ 0.989e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-207ENST00000599232 1747 nt21.12■□□□□ 0.979e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.99e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 CHERP-206ENST00000597261 674 ntTSL 220.34■□□□□ 0.859e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.729e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-203ENST00000596314 718 ntTSL 519■□□□□ 0.639e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.449e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.219e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.129e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-14■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.252e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 AARS-205ENST00000567490 533 ntTSL 210.15□□□□□ -0.781e-11■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.155e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.175e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.185e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 527.82■■■□□ 2.043e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.673e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.63e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.323e-7■□□□□ 10.8
G3BP1Q13283 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.323e-7■□□□□ 10.8
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 19.2 ms