RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000196551.7

RPS5-201, Transcript of ribosomal protein S5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS5, Length 740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS5-201ENST00000196551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.68■■■■□ 3.78
RPS5-201ENST00000196551 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.34■■■■□ 3.09
RPS5-201ENST00000196551 ABCC9O60706 1549 aa33.92■■■■□ 3.02
RPS5-201ENST00000196551 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.46■■■□□ 2.79
RPS5-201ENST00000196551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.41■■■□□ 2.78
RPS5-201ENST00000196551 NACADO15069 1562 aa32.34■■■□□ 2.77
RPS5-201ENST00000196551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
RPS5-201ENST00000196551 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.06■■■□□ 2.72
RPS5-201ENST00000196551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.9■■■□□ 2.7
RPS5-201ENST00000196551 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.76■■■□□ 2.67
RPS5-201ENST00000196551 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.73■■■□□ 2.67
RPS5-201ENST00000196551 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS5-201ENST00000196551 SCRIBQ14160 1630 aa31.47■■■□□ 2.63
RPS5-201ENST00000196551 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.36■■■□□ 2.61
RPS5-201ENST00000196551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.01■■■□□ 2.55
RPS5-201ENST00000196551 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
RPS5-201ENST00000196551 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.62■■■□□ 2.49
RPS5-201ENST00000196551 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.44■■■□□ 2.46
RPS5-201ENST00000196551 SMARCA4P51532 1647 aa30.04■■■□□ 2.4
RPS5-201ENST00000196551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.93■■■□□ 2.38
RPS5-201ENST00000196551 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
RPS5-201ENST00000196551 NCAPD3P42695 1498 aa29.9■■■□□ 2.38
RPS5-201ENST00000196551 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.88■■■□□ 2.37
RPS5-201ENST00000196551 SMARCA2P51531 1590 aa29.8■■■□□ 2.36
RPS5-201ENST00000196551 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.7■■■□□ 2.35
RPS5-201ENST00000196551 HMGXB3Q12766 1538 aa29.7■■■□□ 2.34
RPS5-201ENST00000196551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
RPS5-201ENST00000196551 WIZO95785 1651 aa29.53■■■□□ 2.32
RPS5-201ENST00000196551 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
RPS5-201ENST00000196551 NESP48681 1621 aa29.35■■■□□ 2.29
RPS5-201ENST00000196551 ERCC6Q03468 1493 aa29.16■■■□□ 2.26
RPS5-201ENST00000196551 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
RPS5-201ENST00000196551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.08■■■□□ 2.25
RPS5-201ENST00000196551 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.03■■■□□ 2.24
RPS5-201ENST00000196551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.92■■■□□ 2.22
RPS5-201ENST00000196551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.89■■■□□ 2.22
RPS5-201ENST00000196551 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.86■■■□□ 2.21
RPS5-201ENST00000196551 CUX2O14529 1486 aa28.85■■■□□ 2.21
RPS5-201ENST00000196551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RPS5-201ENST00000196551 CFTRP13569 1480 aa28.84■■■□□ 2.21
RPS5-201ENST00000196551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.72■■■□□ 2.19
RPS5-201ENST00000196551 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
RPS5-201ENST00000196551 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS5-201ENST00000196551 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS5-201ENST00000196551 WDR62O43379 1518 aa28.56■■■□□ 2.16
RPS5-201ENST00000196551 PRDM2Q13029 1718 aa28.51■■■□□ 2.15
RPS5-201ENST00000196551 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
RPS5-201ENST00000196551 TOPBP1Q92547 1522 aa28.25■■■□□ 2.11
RPS5-201ENST00000196551 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.2■■■□□ 2.1
RPS5-201ENST00000196551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.16■■■□□ 2.1
RPS5-201ENST00000196551 ABCC8Q09428 1581 aa28.1■■■□□ 2.09
RPS5-201ENST00000196551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
RPS5-201ENST00000196551 IFT140Q96RY7 1462 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS5-201ENST00000196551 CUX1P39880 1505 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS5-201ENST00000196551 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
RPS5-201ENST00000196551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
RPS5-201ENST00000196551 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.95■■■□□ 2.07
RPS5-201ENST00000196551 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.93■■■□□ 2.06
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RPS5-201ENST00000196551 SOGA1O94964 1423 aa27.87■■■□□ 2.05
RPS5-201ENST00000196551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
RPS5-201ENST00000196551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
RPS5-201ENST00000196551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.032e-9■□□□□ 9.2
RPS5-201ENST00000196551 SYNJ1O43426 1573 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS5-201ENST00000196551 TOP2BQ02880 1626 aa27.67■■■□□ 2.02
RPS5-201ENST00000196551 OSCARQ8IYS5 282 aa27.67■■■□□ 2.02
RPS5-201ENST00000196551 WDR97A6NE52 1622 aa27.67■■■□□ 2.02
RPS5-201ENST00000196551 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.67■■■□□ 2.02
RPS5-201ENST00000196551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.6■■■□□ 2.01
RPS5-201ENST00000196551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.57■■■□□ 2
RPS5-201ENST00000196551 FBLN2P98095 1184 aa27.54■■■□□ 2
RPS5-201ENST00000196551 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.54■■■□□ 2
RPS5-201ENST00000196551 CHD1O14646 1710 aa27.53■■■□□ 2
RPS5-201ENST00000196551 GRIN2BQ13224 1484 aa27.53■■■□□ 2
RPS5-201ENST00000196551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.52■■■□□ 2
RPS5-201ENST00000196551 PBRM1Q86U86 1689 aa27.47■■□□□ 1.99
RPS5-201ENST00000196551 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
RPS5-201ENST00000196551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
RPS5-201ENST00000196551 SYNJ2O15056 1496 aa27.37■■□□□ 1.97
RPS5-201ENST00000196551 TRIM41Q8WV44 630 aa27.3■■□□□ 1.96
RPS5-201ENST00000196551 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.28■■□□□ 1.96
RPS5-201ENST00000196551 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.28■■□□□ 1.96
RPS5-201ENST00000196551 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.28■■□□□ 1.96
RPS5-201ENST00000196551 ADAMTS12P58397 1594 aa27.26■■□□□ 1.96
RPS5-201ENST00000196551 ARHGEF11O15085 1522 aa27.26■■□□□ 1.96
RPS5-201ENST00000196551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.24■■□□□ 1.95
RPS5-201ENST00000196551 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.24■■□□□ 1.95
RPS5-201ENST00000196551 GRIN2AQ12879 1464 aa27.2■■□□□ 1.95
RPS5-201ENST00000196551 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.19■■□□□ 1.94
RPS5-201ENST00000196551 KIF27Q86VH2 1401 aa27.14■■□□□ 1.93
RPS5-201ENST00000196551 IGF1RP08069 1367 aa27.12■■□□□ 1.93
RPS5-201ENST00000196551 CEP170Q5SW79 1584 aa27.11■■□□□ 1.93
RPS5-201ENST00000196551 NUP160Q12769 1436 aa27.09■■□□□ 1.93
RPS5-201ENST00000196551 ARAP1Q96P48 1450 aa27.06■■□□□ 1.92
RPS5-201ENST00000196551 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.06■■□□□ 1.92
RPS5-201ENST00000196551 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.02■■□□□ 1.92
RPS5-201ENST00000196551 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.97■■□□□ 1.91
RPS5-201ENST00000196551 CUL7Q14999 1698 aa26.93■■□□□ 1.9
RPS5-201ENST00000196551 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.93■■□□□ 1.9
RPS5-201ENST00000196551 SHROOM2Q13796 1616 aa26.87■■□□□ 1.89
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