Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-247ENST00000592630 666 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 198.7
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UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-259ENST00000626117 572 ntTSL 56.42□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-266ENST00000628296 483 ntTSL 55.76□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP42-208ENST00000534060 501 ntTSL 35.75□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-209ENST00000532806 747 ntTSL 521.39■■□□□ 1.013e-13■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 198.7
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UTP3Q9NQZ2 CLDN12-204ENST00000416322 1163 ntTSL 510.37□□□□□ -0.755e-13■■■■■ 198.6
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UTP3Q9NQZ2 CISH-203ENST00000491847 5042 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 198.5
UTP3Q9NQZ2 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.871e-9■■■■■ 198.3
UTP3Q9NQZ2 ANXA11-206ENST00000447489 750 ntTSL 316.68■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 198
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UTP3Q9NQZ2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 198
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UTP3Q9NQZ2 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 198
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UTP3Q9NQZ2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 198
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 198
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 216.36■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 197.9
UTP3Q9NQZ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.791e-6■■■■■ 197.9
UTP3Q9NQZ2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 197.9
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UTP3Q9NQZ2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 197.9
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-29■■■■■ 197.8
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-207ENST00000428959 584 ntTSL 39.09□□□□□ -0.952e-29■■■■■ 197.8
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UTP3Q9NQZ2 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 312.4□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 197.7
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UTP3Q9NQZ2 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 197.7
UTP3Q9NQZ2 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 212.07□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 197.7
UTP3Q9NQZ2 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 29.65□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 197.7
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UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 197.7
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-207ENST00000580104 5014 ntTSL 215.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 197.7
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 197.7
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UTP3Q9NQZ2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.15e-8■■■■■ 197.4
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 197.4
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 197.4
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 197.4
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.755e-8■■■■■ 197.4
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UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 197.3
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 197.3
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UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 197.3
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 197.3
UTP3Q9NQZ2 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 197.3
UTP3Q9NQZ2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 197.2
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UTP3Q9NQZ2 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 197.2
UTP3Q9NQZ2 SACS-204ENST00000455470 2784 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 197.2
UTP3Q9NQZ2 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 197.2
UTP3Q9NQZ2 TECPR1-208ENST00000471397 774 ntTSL 320.82■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-12■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-12■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 LAMB2-208ENST00000477701 559 ntTSL 214.59□□□□□ -0.074e-12■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 LAMB2-213ENST00000486298 590 ntTSL 414.51□□□□□ -0.094e-12■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 313.85□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 CBR4-207ENST00000510042 1198 ntTSL 212.55□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA2-213ENST00000512860 552 ntTSL 48.36□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 DLEU1-211ENST00000469127 320 ntTSL 58.1□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 DLEU1-205ENST00000463357 274 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 48.25□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 197.1
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 422.85■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 196.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 196.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 196.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 196.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-214ENST00000488107 416 ntTSL 58.19□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 196.7
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 196.5
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-209ENST00000520495 3286 ntTSL 216.29■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 196.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 196.5
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 196.5
UTP3Q9NQZ2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.168e-9■■■■■ 196.3
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