RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482808.1

CAPZB-208, Transcript of capping actin protein of muscle Z-line subunit beta, human

TSL 2

Gene CAPZB, Length 660 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPZB-208	ENST00000482808	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.08	■■■■□ 3.85
CAPZB-208	ENST00000482808	ABCC9	O60706	1549 aa		35.29	■■■■□ 3.24
CAPZB-208	ENST00000482808	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.15	■■■■□ 3.22
CAPZB-208	ENST00000482808	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CAPZB-208	ENST00000482808	NACAD	O15069	1562 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CAPZB-208	ENST00000482808	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CAPZB-208	ENST00000482808	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPZB-208	ENST00000482808	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
CAPZB-208	ENST00000482808	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CAPZB-208	ENST00000482808	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPZB-208	ENST00000482808	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.54	■■■□□ 2.8
CAPZB-208	ENST00000482808	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
CAPZB-208	ENST00000482808	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CAPZB-208	ENST00000482808	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CAPZB-208	ENST00000482808	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CAPZB-208	ENST00000482808	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.87	■■■□□ 2.69
CAPZB-208	ENST00000482808	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CAPZB-208	ENST00000482808	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
CAPZB-208	ENST00000482808	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.74	■■■□□ 2.51
CAPZB-208	ENST00000482808	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.7	■■■□□ 2.51
CAPZB-208	ENST00000482808	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.6	■■■□□ 2.49
CAPZB-208	ENST00000482808	CUX2	O14529	1486 aa		30.54	■■■□□ 2.48
CAPZB-208	ENST00000482808	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.53	■■■□□ 2.48
CAPZB-208	ENST00000482808	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.51	■■■□□ 2.48
CAPZB-208	ENST00000482808	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.51	■■■□□ 2.48
CAPZB-208	ENST00000482808	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.49	■■■□□ 2.47
CAPZB-208	ENST00000482808	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.36	■■■□□ 2.45
CAPZB-208	ENST00000482808	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.31	■■■□□ 2.44
CAPZB-208	ENST00000482808	NES	P48681	1621 aa		30.25	■■■□□ 2.43
CAPZB-208	ENST00000482808	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.24	■■■□□ 2.43
CAPZB-208	ENST00000482808	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.09	■■■□□ 2.41
CAPZB-208	ENST00000482808	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CAPZB-208	ENST00000482808	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
CAPZB-208	ENST00000482808	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CAPZB-208	ENST00000482808	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CAPZB-208	ENST00000482808	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CAPZB-208	ENST00000482808	WIZ	O95785	1651 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CAPZB-208	ENST00000482808	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.65	■■■□□ 2.34
CAPZB-208	ENST00000482808	WDR62	O43379	1518 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CAPZB-208	ENST00000482808	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.5	■■■□□ 2.31
CAPZB-208	ENST00000482808	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CAPZB-208	ENST00000482808	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CAPZB-208	ENST00000482808	CFTR	P13569	1480 aa		29.41	■■■□□ 2.3
CAPZB-208	ENST00000482808	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
CAPZB-208	ENST00000482808	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CAPZB-208	ENST00000482808	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
CAPZB-208	ENST00000482808	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CAPZB-208	ENST00000482808	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CAPZB-208	ENST00000482808	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CAPZB-208	ENST00000482808	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CAPZB-208	ENST00000482808	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CAPZB-208	ENST00000482808	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CAPZB-208	ENST00000482808	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CAPZB-208	ENST00000482808	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CAPZB-208	ENST00000482808	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.7	■■■□□ 2.19
CAPZB-208	ENST00000482808	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.7	■■■□□ 2.19
CAPZB-208	ENST00000482808	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.7	■■■□□ 2.19
CAPZB-208	ENST00000482808	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CAPZB-208	ENST00000482808	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CAPZB-208	ENST00000482808	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CAPZB-208	ENST00000482808	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.58	■■■□□ 2.17
CAPZB-208	ENST00000482808	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CAPZB-208	ENST00000482808	CHD1	O14646	1710 aa		28.49	■■■□□ 2.15
CAPZB-208	ENST00000482808	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CAPZB-208	ENST00000482808	FBLN2	P98095	1184 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CAPZB-208	ENST00000482808	SOGA1	O94964	1423 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CAPZB-208	ENST00000482808	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CAPZB-208	ENST00000482808	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
CAPZB-208	ENST00000482808	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CAPZB-208	ENST00000482808	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CAPZB-208	ENST00000482808	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CAPZB-208	ENST00000482808	CUX1	P39880	1505 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CAPZB-208	ENST00000482808	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CAPZB-208	ENST00000482808	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
CAPZB-208	ENST00000482808	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CAPZB-208	ENST00000482808	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
CAPZB-208	ENST00000482808	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CAPZB-208	ENST00000482808	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CAPZB-208	ENST00000482808	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CAPZB-208	ENST00000482808	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CAPZB-208	ENST00000482808	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.08	■■■□□ 2.09
CAPZB-208	ENST00000482808	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CAPZB-208	ENST00000482808	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CAPZB-208	ENST00000482808	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CAPZB-208	ENST00000482808	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CAPZB-208	ENST00000482808	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.91	■■■□□ 2.06	7e-6	■■■■■ 52.9
CAPZB-208	ENST00000482808	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CAPZB-208	ENST00000482808	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPZB-208	ENST00000482808	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CAPZB-208	ENST00000482808	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CAPZB-208	ENST00000482808	NUP160	Q12769	1436 aa		27.76	■■■□□ 2.04
CAPZB-208	ENST00000482808	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPZB-208	ENST00000482808	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPZB-208	ENST00000482808	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.7	■■■□□ 2.03
CAPZB-208	ENST00000482808	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPZB-208	ENST00000482808	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CAPZB-208	ENST00000482808	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
CAPZB-208	ENST00000482808	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
CAPZB-208	ENST00000482808	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CAPZB-208	ENST00000482808	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.41	■■□□□ 1.98

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