Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMP5Q9UJQ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMP5Q9UJQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMP5Q9UJQ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMP5Q9UJQ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP5Q9UJQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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