Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX43Q9NXZ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX43Q9NXZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX43Q9NXZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX43Q9NXZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX43Q9NXZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms