Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FOXD4L1Q9NU39 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD4L1Q9NU39 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOXD4L1Q9NU39 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms