Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TREX1Q9NSU2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREX1Q9NSU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TREX1Q9NSU2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TREX1Q9NSU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TREX1Q9NSU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms