Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALMDQ9NP74 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALMDQ9NP74 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALMDQ9NP74 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALMDQ9NP74 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms