Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PALMDQ9NP74 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PALMDQ9NP74 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PALMDQ9NP74 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALMDQ9NP74 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALMDQ9NP74 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PALMDQ9NP74 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PALMDQ9NP74 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PALMDQ9NP74 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALMDQ9NP74 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PALMDQ9NP74 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALMDQ9NP74 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PALMDQ9NP74 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PALMDQ9NP74 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PALMDQ9NP74 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALMDQ9NP74 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALMDQ9NP74 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALMDQ9NP74 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALMDQ9NP74 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALMDQ9NP74 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALMDQ9NP74 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALMDQ9NP74 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PALMDQ9NP74 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALMDQ9NP74 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALMDQ9NP74 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALMDQ9NP74 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALMDQ9NP74 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALMDQ9NP74 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALMDQ9NP74 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALMDQ9NP74 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALMDQ9NP74 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALMDQ9NP74 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALMDQ9NP74 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALMDQ9NP74 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALMDQ9NP74 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALMDQ9NP74 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALMDQ9NP74 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALMDQ9NP74 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALMDQ9NP74 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALMDQ9NP74 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALMDQ9NP74 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALMDQ9NP74 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALMDQ9NP74 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PALMDQ9NP74 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALMDQ9NP74 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALMDQ9NP74 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALMDQ9NP74 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALMDQ9NP74 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALMDQ9NP74 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALMDQ9NP74 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALMDQ9NP74 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALMDQ9NP74 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALMDQ9NP74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALMDQ9NP74 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PALMDQ9NP74 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALMDQ9NP74 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALMDQ9NP74 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALMDQ9NP74 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALMDQ9NP74 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALMDQ9NP74 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALMDQ9NP74 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALMDQ9NP74 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALMDQ9NP74 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALMDQ9NP74 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMDQ9NP74 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALMDQ9NP74 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALMDQ9NP74 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALMDQ9NP74 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALMDQ9NP74 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALMDQ9NP74 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PALMDQ9NP74 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PALMDQ9NP74 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALMDQ9NP74 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALMDQ9NP74 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALMDQ9NP74 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALMDQ9NP74 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PALMDQ9NP74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALMDQ9NP74 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALMDQ9NP74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALMDQ9NP74 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALMDQ9NP74 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALMDQ9NP74 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALMDQ9NP74 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALMDQ9NP74 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALMDQ9NP74 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALMDQ9NP74 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALMDQ9NP74 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PALMDQ9NP74 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMDQ9NP74 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALMDQ9NP74 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMDQ9NP74 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMDQ9NP74 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms