Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD2Q9H8S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD2Q9H8S5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTD2Q9H8S5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms