Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTD2Q9H8S5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTD2Q9H8S5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTD2Q9H8S5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTD2Q9H8S5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTD2Q9H8S5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CNTD2Q9H8S5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTD2Q9H8S5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTD2Q9H8S5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTD2Q9H8S5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTD2Q9H8S5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTD2Q9H8S5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTD2Q9H8S5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTD2Q9H8S5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTD2Q9H8S5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTD2Q9H8S5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTD2Q9H8S5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTD2Q9H8S5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTD2Q9H8S5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTD2Q9H8S5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTD2Q9H8S5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTD2Q9H8S5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTD2Q9H8S5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTD2Q9H8S5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTD2Q9H8S5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTD2Q9H8S5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTD2Q9H8S5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTD2Q9H8S5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTD2Q9H8S5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTD2Q9H8S5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTD2Q9H8S5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTD2Q9H8S5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTD2Q9H8S5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTD2Q9H8S5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTD2Q9H8S5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTD2Q9H8S5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTD2Q9H8S5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTD2Q9H8S5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTD2Q9H8S5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTD2Q9H8S5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD2Q9H8S5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD2Q9H8S5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTD2Q9H8S5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTD2Q9H8S5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTD2Q9H8S5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD2Q9H8S5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTD2Q9H8S5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTD2Q9H8S5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTD2Q9H8S5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTD2Q9H8S5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTD2Q9H8S5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTD2Q9H8S5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTD2Q9H8S5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTD2Q9H8S5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTD2Q9H8S5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTD2Q9H8S5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTD2Q9H8S5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTD2Q9H8S5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTD2Q9H8S5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTD2Q9H8S5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTD2Q9H8S5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTD2Q9H8S5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTD2Q9H8S5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTD2Q9H8S5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTD2Q9H8S5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTD2Q9H8S5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTD2Q9H8S5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTD2Q9H8S5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTD2Q9H8S5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD2Q9H8S5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD2Q9H8S5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTD2Q9H8S5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD2Q9H8S5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTD2Q9H8S5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTD2Q9H8S5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD2Q9H8S5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTD2Q9H8S5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTD2Q9H8S5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD2Q9H8S5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTD2Q9H8S5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTD2Q9H8S5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTD2Q9H8S5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTD2Q9H8S5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTD2Q9H8S5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD2Q9H8S5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD2Q9H8S5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTD2Q9H8S5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD2Q9H8S5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTD2Q9H8S5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTD2Q9H8S5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTD2Q9H8S5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTD2Q9H8S5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTD2Q9H8S5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTD2Q9H8S5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTD2Q9H8S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTD2Q9H8S5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD2Q9H8S5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTD2Q9H8S5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD2Q9H8S5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTD2Q9H8S5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms