Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REEP4Q9H6H4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP4Q9H6H4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
REEP4Q9H6H4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
REEP4Q9H6H4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP4Q9H6H4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms