Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOXF2Q9BQY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOXF2Q9BQY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOXF2Q9BQY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHOXF2Q9BQY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms