Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP8Q99708 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBBP8Q99708 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP8Q99708 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBBP8Q99708 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBBP8Q99708 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms