Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3CQ99613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3CQ99613 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF3CQ99613 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF3CQ99613 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF3CQ99613 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF3CQ99613 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF3CQ99613 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF3CQ99613 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3CQ99613 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3CQ99613 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3CQ99613 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF3CQ99613 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3CQ99613 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF3CQ99613 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EIF3CQ99613 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EIF3CQ99613 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3CQ99613 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3CQ99613 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF3CQ99613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF3CQ99613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF3CQ99613 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EIF3CQ99613 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF3CQ99613 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms