Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INPP4AQ96PE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INPP4AQ96PE3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
INPP4AQ96PE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INPP4AQ96PE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms