Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JSRP1Q96MG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JSRP1Q96MG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JSRP1Q96MG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JSRP1Q96MG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms