Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C9orf72Q96LT7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C9orf72Q96LT7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf72Q96LT7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms