Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM41AQ96HV5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM41AQ96HV5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM41AQ96HV5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM41AQ96HV5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms