Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL2Q92772 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL2Q92772 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL2Q92772 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms