Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D7

NKAIN3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3Q8N8D7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKAIN3Q8N8D7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKAIN3Q8N8D7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKAIN3Q8N8D7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKAIN3Q8N8D7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKAIN3Q8N8D7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms