Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD4AQ8N468 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD4AQ8N468 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD4AQ8N468 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD4AQ8N468 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms