Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MFSD4AQ8N468 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MFSD4AQ8N468 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MFSD4AQ8N468 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MFSD4AQ8N468 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MFSD4AQ8N468 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MFSD4AQ8N468 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MFSD4AQ8N468 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MFSD4AQ8N468 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MFSD4AQ8N468 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MFSD4AQ8N468 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MFSD4AQ8N468 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MFSD4AQ8N468 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MFSD4AQ8N468 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MFSD4AQ8N468 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MFSD4AQ8N468 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFSD4AQ8N468 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MFSD4AQ8N468 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MFSD4AQ8N468 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFSD4AQ8N468 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFSD4AQ8N468 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFSD4AQ8N468 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFSD4AQ8N468 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFSD4AQ8N468 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MFSD4AQ8N468 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MFSD4AQ8N468 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFSD4AQ8N468 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFSD4AQ8N468 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MFSD4AQ8N468 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFSD4AQ8N468 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFSD4AQ8N468 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MFSD4AQ8N468 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFSD4AQ8N468 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MFSD4AQ8N468 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD4AQ8N468 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD4AQ8N468 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD4AQ8N468 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD4AQ8N468 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD4AQ8N468 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD4AQ8N468 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD4AQ8N468 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD4AQ8N468 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD4AQ8N468 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD4AQ8N468 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD4AQ8N468 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD4AQ8N468 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD4AQ8N468 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD4AQ8N468 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD4AQ8N468 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD4AQ8N468 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD4AQ8N468 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MFSD4AQ8N468 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD4AQ8N468 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD4AQ8N468 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD4AQ8N468 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD4AQ8N468 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD4AQ8N468 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD4AQ8N468 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MFSD4AQ8N468 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD4AQ8N468 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD4AQ8N468 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MFSD4AQ8N468 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD4AQ8N468 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD4AQ8N468 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD4AQ8N468 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD4AQ8N468 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD4AQ8N468 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MFSD4AQ8N468 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFSD4AQ8N468 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD4AQ8N468 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFSD4AQ8N468 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD4AQ8N468 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFSD4AQ8N468 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFSD4AQ8N468 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFSD4AQ8N468 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MFSD4AQ8N468 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MFSD4AQ8N468 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MFSD4AQ8N468 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MFSD4AQ8N468 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MFSD4AQ8N468 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD4AQ8N468 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD4AQ8N468 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD4AQ8N468 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD4AQ8N468 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD4AQ8N468 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD4AQ8N468 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD4AQ8N468 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD4AQ8N468 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD4AQ8N468 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD4AQ8N468 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD4AQ8N468 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD4AQ8N468 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 722.4 ms