Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C4orf50Q6ZRC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4orf50Q6ZRC1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C4orf50Q6ZRC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4orf50Q6ZRC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4orf50Q6ZRC1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4orf50Q6ZRC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C4orf50Q6ZRC1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4orf50Q6ZRC1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4orf50Q6ZRC1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms