Protein–RNA interactions for Protein: Q6QN14

USP17L6P, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L6PQ6QN14 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP17L6PQ6QN14 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L6PQ6QN14 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L6PQ6QN14 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L6PQ6QN14 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
USP17L6PQ6QN14 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L6PQ6QN14 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms