Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB12Q6IQ22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB12Q6IQ22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB12Q6IQ22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB12Q6IQ22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms