Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PITRM1Q5JRX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PITRM1Q5JRX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PITRM1Q5JRX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITRM1Q5JRX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITRM1Q5JRX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITRM1Q5JRX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms