Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD55Q3KP44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD55Q3KP44 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD55Q3KP44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD55Q3KP44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms