Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS1Q14691 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINS1Q14691 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS1Q14691 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS1Q14691 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS1Q14691 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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