Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPS1Q13098 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPS1Q13098 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPS1Q13098 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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