Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN1Q05586 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN1Q05586 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN1Q05586 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN1Q05586 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms