Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPN12Q05209 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPN12Q05209 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPN12Q05209 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPN12Q05209 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPN12Q05209 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms