Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRYQ05066 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRYQ05066 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRYQ05066 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRYQ05066 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRYQ05066 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRYQ05066 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRYQ05066 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRYQ05066 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRYQ05066 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRYQ05066 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRYQ05066 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRYQ05066 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRYQ05066 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRYQ05066 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRYQ05066 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRYQ05066 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRYQ05066 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRYQ05066 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRYQ05066 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRYQ05066 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRYQ05066 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRYQ05066 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRYQ05066 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRYQ05066 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRYQ05066 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRYQ05066 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRYQ05066 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRYQ05066 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRYQ05066 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRYQ05066 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRYQ05066 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRYQ05066 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SRYQ05066 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRYQ05066 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRYQ05066 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRYQ05066 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRYQ05066 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRYQ05066 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRYQ05066 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRYQ05066 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRYQ05066 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRYQ05066 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRYQ05066 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRYQ05066 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRYQ05066 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRYQ05066 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRYQ05066 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRYQ05066 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRYQ05066 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRYQ05066 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRYQ05066 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRYQ05066 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRYQ05066 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRYQ05066 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRYQ05066 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRYQ05066 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRYQ05066 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRYQ05066 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRYQ05066 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRYQ05066 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRYQ05066 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRYQ05066 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRYQ05066 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRYQ05066 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRYQ05066 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRYQ05066 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRYQ05066 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRYQ05066 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRYQ05066 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRYQ05066 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRYQ05066 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRYQ05066 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRYQ05066 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRYQ05066 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRYQ05066 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRYQ05066 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRYQ05066 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRYQ05066 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRYQ05066 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms