Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ROM1Q03395 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ROM1Q03395 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROM1Q03395 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROM1Q03395 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms