Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP46P62068 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP46P62068 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP46P62068 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP46P62068 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP46P62068 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP46P62068 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP46P62068 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP46P62068 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP46P62068 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP46P62068 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP46P62068 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP46P62068 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP46P62068 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP46P62068 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP46P62068 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP46P62068 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP46P62068 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP46P62068 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP46P62068 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP46P62068 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP46P62068 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP46P62068 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP46P62068 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP46P62068 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP46P62068 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP46P62068 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP46P62068 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP46P62068 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP46P62068 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP46P62068 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP46P62068 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP46P62068 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP46P62068 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP46P62068 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP46P62068 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP46P62068 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP46P62068 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP46P62068 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP46P62068 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP46P62068 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP46P62068 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP46P62068 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP46P62068 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP46P62068 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP46P62068 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP46P62068 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP46P62068 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP46P62068 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP46P62068 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP46P62068 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP46P62068 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP46P62068 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP46P62068 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP46P62068 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP46P62068 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP46P62068 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP46P62068 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP46P62068 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP46P62068 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP46P62068 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP46P62068 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP46P62068 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP46P62068 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP46P62068 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP46P62068 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP46P62068 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP46P62068 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP46P62068 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP46P62068 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP46P62068 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP46P62068 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP46P62068 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP46P62068 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP46P62068 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP46P62068 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP46P62068 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP46P62068 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP46P62068 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP46P62068 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP46P62068 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP46P62068 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP46P62068 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP46P62068 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP46P62068 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP46P62068 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP46P62068 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP46P62068 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP46P62068 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP46P62068 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP46P62068 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP46P62068 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms